Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIZ9

TRAT1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAT1Q6PIZ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAT1Q6PIZ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAT1Q6PIZ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAT1Q6PIZ9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAT1Q6PIZ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAT1Q6PIZ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms