Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RNF123Q5XPI4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
RNF123Q5XPI4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RNF123Q5XPI4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RNF123Q5XPI4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
RNF123Q5XPI4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RNF123Q5XPI4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
RNF123Q5XPI4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RNF123Q5XPI4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
RNF123Q5XPI4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
RNF123Q5XPI4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RNF123Q5XPI4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RNF123Q5XPI4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RNF123Q5XPI4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RNF123Q5XPI4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RNF123Q5XPI4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RNF123Q5XPI4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RNF123Q5XPI4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RNF123Q5XPI4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF123Q5XPI4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RNF123Q5XPI4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RNF123Q5XPI4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RNF123Q5XPI4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RNF123Q5XPI4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RNF123Q5XPI4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RNF123Q5XPI4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RNF123Q5XPI4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RNF123Q5XPI4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RNF123Q5XPI4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RNF123Q5XPI4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RNF123Q5XPI4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RNF123Q5XPI4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RNF123Q5XPI4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RNF123Q5XPI4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RNF123Q5XPI4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RNF123Q5XPI4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RNF123Q5XPI4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RNF123Q5XPI4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RNF123Q5XPI4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
RNF123Q5XPI4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RNF123Q5XPI4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms