Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
RNF123Q5XPI4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RNF123Q5XPI4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
RNF123Q5XPI4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.01■■■■■ 4.48
RNF123Q5XPI4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.82■■■■■ 4.45
RNF123Q5XPI4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.44
RNF123Q5XPI4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
RNF123Q5XPI4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
RNF123Q5XPI4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
RNF123Q5XPI4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RNF123Q5XPI4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
RNF123Q5XPI4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
RNF123Q5XPI4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RNF123Q5XPI4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RNF123Q5XPI4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
RNF123Q5XPI4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
RNF123Q5XPI4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
RNF123Q5XPI4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RNF123Q5XPI4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RNF123Q5XPI4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
RNF123Q5XPI4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
RNF123Q5XPI4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RNF123Q5XPI4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RNF123Q5XPI4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RNF123Q5XPI4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RNF123Q5XPI4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RNF123Q5XPI4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RNF123Q5XPI4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
RNF123Q5XPI4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
RNF123Q5XPI4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
RNF123Q5XPI4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
RNF123Q5XPI4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
RNF123Q5XPI4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RNF123Q5XPI4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RNF123Q5XPI4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RNF123Q5XPI4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RNF123Q5XPI4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RNF123Q5XPI4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
RNF123Q5XPI4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
RNF123Q5XPI4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
RNF123Q5XPI4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RNF123Q5XPI4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RNF123Q5XPI4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
RNF123Q5XPI4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RNF123Q5XPI4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RNF123Q5XPI4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
RNF123Q5XPI4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
RNF123Q5XPI4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
RNF123Q5XPI4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
RNF123Q5XPI4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
RNF123Q5XPI4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RNF123Q5XPI4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
RNF123Q5XPI4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RNF123Q5XPI4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RNF123Q5XPI4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RNF123Q5XPI4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RNF123Q5XPI4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RNF123Q5XPI4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RNF123Q5XPI4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
RNF123Q5XPI4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RNF123Q5XPI4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
RNF123Q5XPI4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RNF123Q5XPI4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
RNF123Q5XPI4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RNF123Q5XPI4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RNF123Q5XPI4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
RNF123Q5XPI4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
RNF123Q5XPI4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RNF123Q5XPI4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RNF123Q5XPI4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
RNF123Q5XPI4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RNF123Q5XPI4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
RNF123Q5XPI4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RNF123Q5XPI4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
RNF123Q5XPI4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RNF123Q5XPI4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RNF123Q5XPI4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RNF123Q5XPI4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RNF123Q5XPI4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RNF123Q5XPI4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RNF123Q5XPI4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RNF123Q5XPI4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RNF123Q5XPI4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
RNF123Q5XPI4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RNF123Q5XPI4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RNF123Q5XPI4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RNF123Q5XPI4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RNF123Q5XPI4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RNF123Q5XPI4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RNF123Q5XPI4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
RNF123Q5XPI4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
RNF123Q5XPI4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
RNF123Q5XPI4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RNF123Q5XPI4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RNF123Q5XPI4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RNF123Q5XPI4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RNF123Q5XPI4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RNF123Q5XPI4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RNF123Q5XPI4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RNF123Q5XPI4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.3 ms