Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD20A3Q5VUR7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD20A3Q5VUR7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD20A3Q5VUR7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD20A3Q5VUR7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD20A3Q5VUR7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD20A3Q5VUR7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD20A3Q5VUR7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ANKRD20A3Q5VUR7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ANKRD20A3Q5VUR7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ANKRD20A3Q5VUR7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD20A3Q5VUR7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms