Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHDC7AQ5VTJ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC7AQ5VTJ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KLHDC7AQ5VTJ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KLHDC7AQ5VTJ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHDC7AQ5VTJ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KLHDC7AQ5VTJ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHDC7AQ5VTJ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHDC7AQ5VTJ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHDC7AQ5VTJ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms