Protein–RNA interactions for Protein: Q5T197

DCST1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCST1Q5T197 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCST1Q5T197 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCST1Q5T197 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCST1Q5T197 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCST1Q5T197 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCST1Q5T197 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCST1Q5T197 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCST1Q5T197 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCST1Q5T197 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCST1Q5T197 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCST1Q5T197 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCST1Q5T197 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCST1Q5T197 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCST1Q5T197 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCST1Q5T197 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCST1Q5T197 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCST1Q5T197 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCST1Q5T197 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCST1Q5T197 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCST1Q5T197 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCST1Q5T197 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms