Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF1Q13905 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAPGEF1Q13905 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAPGEF1Q13905 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF1Q13905 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF1Q13905 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF1Q13905 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF1Q13905 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF1Q13905 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF1Q13905 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF1Q13905 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF1Q13905 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAPGEF1Q13905 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
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