Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS4XP62701 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS4XP62701 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS4XP62701 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4XP62701 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms