Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00205P59089 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00205P59089 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00205P59089 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00205P59089 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00205P59089 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms