Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1B3P54709 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1B3P54709 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1B3P54709 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1B3P54709 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1B3P54709 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1B3P54709 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms