Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KPNA2P52292 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KPNA2P52292 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KPNA2P52292 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KPNA2P52292 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA2P52292 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms