Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AFMP43652 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AFMP43652 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
AFMP43652 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AFMP43652 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFMP43652 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFMP43652 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFMP43652 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFMP43652 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
AFMP43652 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFMP43652 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AFMP43652 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AFMP43652 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
AFMP43652 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
AFMP43652 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AFMP43652 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AFMP43652 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
AFMP43652 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AFMP43652 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AFMP43652 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
AFMP43652 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
AFMP43652 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
AFMP43652 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
AFMP43652 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AFMP43652 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AFMP43652 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AFMP43652 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AFMP43652 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AFMP43652 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFMP43652 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFMP43652 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFMP43652 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFMP43652 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFMP43652 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AFMP43652 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AFMP43652 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFMP43652 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFMP43652 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFMP43652 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFMP43652 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AFMP43652 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AFMP43652 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AFMP43652 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
AFMP43652 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
AFMP43652 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
AFMP43652 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AFMP43652 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AFMP43652 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
AFMP43652 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
AFMP43652 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
AFMP43652 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
AFMP43652 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AFMP43652 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
AFMP43652 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
AFMP43652 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
AFMP43652 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
AFMP43652 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
AFMP43652 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
AFMP43652 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
AFMP43652 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
AFMP43652 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AFMP43652 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFMP43652 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
AFMP43652 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AFMP43652 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
AFMP43652 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
AFMP43652 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AFMP43652 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
AFMP43652 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
AFMP43652 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
AFMP43652 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
AFMP43652 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AFMP43652 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
AFMP43652 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AFMP43652 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AFMP43652 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
AFMP43652 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AFMP43652 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
AFMP43652 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AFMP43652 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AFMP43652 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AFMP43652 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AFMP43652 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AFMP43652 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
AFMP43652 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
AFMP43652 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AFMP43652 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AFMP43652 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AFMP43652 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AFMP43652 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AFMP43652 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AFMP43652 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AFMP43652 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AFMP43652 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AFMP43652 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
AFMP43652 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
AFMP43652 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AFMP43652 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
AFMP43652 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
AFMP43652 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms