Protein–RNA interactions for Protein: P07996

THBS1, Thrombospondin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1P07996 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THBS1P07996 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
THBS1P07996 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THBS1P07996 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THBS1P07996 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THBS1P07996 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
THBS1P07996 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THBS1P07996 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THBS1P07996 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THBS1P07996 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THBS1P07996 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THBS1P07996 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
THBS1P07996 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THBS1P07996 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THBS1P07996 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THBS1P07996 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THBS1P07996 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THBS1P07996 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THBS1P07996 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THBS1P07996 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THBS1P07996 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THBS1P07996 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THBS1P07996 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THBS1P07996 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THBS1P07996 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THBS1P07996 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THBS1P07996 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THBS1P07996 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THBS1P07996 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THBS1P07996 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THBS1P07996 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THBS1P07996 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THBS1P07996 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THBS1P07996 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THBS1P07996 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THBS1P07996 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THBS1P07996 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THBS1P07996 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THBS1P07996 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THBS1P07996 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THBS1P07996 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THBS1P07996 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THBS1P07996 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THBS1P07996 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THBS1P07996 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THBS1P07996 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THBS1P07996 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THBS1P07996 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THBS1P07996 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THBS1P07996 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THBS1P07996 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THBS1P07996 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THBS1P07996 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THBS1P07996 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THBS1P07996 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THBS1P07996 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THBS1P07996 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THBS1P07996 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THBS1P07996 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THBS1P07996 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THBS1P07996 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THBS1P07996 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THBS1P07996 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THBS1P07996 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THBS1P07996 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THBS1P07996 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THBS1P07996 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THBS1P07996 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THBS1P07996 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THBS1P07996 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THBS1P07996 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THBS1P07996 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THBS1P07996 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THBS1P07996 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
THBS1P07996 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THBS1P07996 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THBS1P07996 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THBS1P07996 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THBS1P07996 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THBS1P07996 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THBS1P07996 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
THBS1P07996 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THBS1P07996 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THBS1P07996 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THBS1P07996 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THBS1P07996 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THBS1P07996 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THBS1P07996 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THBS1P07996 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THBS1P07996 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THBS1P07996 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THBS1P07996 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THBS1P07996 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THBS1P07996 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THBS1P07996 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THBS1P07996 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THBS1P07996 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THBS1P07996 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
THBS1P07996 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THBS1P07996 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms