Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAF1P04049 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAF1P04049 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAF1P04049 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAF1P04049 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAF1P04049 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAF1P04049 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAF1P04049 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAF1P04049 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAF1P04049 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAF1P04049 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAF1P04049 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAF1P04049 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAF1P04049 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAF1P04049 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAF1P04049 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAF1P04049 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAF1P04049 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAF1P04049 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAF1P04049 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAF1P04049 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAF1P04049 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAF1P04049 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAF1P04049 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAF1P04049 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAF1P04049 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAF1P04049 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAF1P04049 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAF1P04049 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAF1P04049 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAF1P04049 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAF1P04049 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAF1P04049 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAF1P04049 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAF1P04049 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAF1P04049 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAF1P04049 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAF1P04049 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAF1P04049 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAF1P04049 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAF1P04049 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAF1P04049 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAF1P04049 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAF1P04049 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAF1P04049 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAF1P04049 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAF1P04049 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAF1P04049 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAF1P04049 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAF1P04049 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAF1P04049 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAF1P04049 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAF1P04049 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAF1P04049 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAF1P04049 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAF1P04049 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAF1P04049 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAF1P04049 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAF1P04049 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAF1P04049 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAF1P04049 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAF1P04049 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAF1P04049 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAF1P04049 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAF1P04049 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAF1P04049 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAF1P04049 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAF1P04049 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAF1P04049 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAF1P04049 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAF1P04049 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAF1P04049 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAF1P04049 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAF1P04049 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAF1P04049 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAF1P04049 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAF1P04049 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAF1P04049 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAF1P04049 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAF1P04049 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAF1P04049 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAF1P04049 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAF1P04049 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAF1P04049 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAF1P04049 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAF1P04049 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAF1P04049 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAF1P04049 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAF1P04049 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAF1P04049 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAF1P04049 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAF1P04049 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAF1P04049 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAF1P04049 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAF1P04049 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAF1P04049 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAF1P04049 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAF1P04049 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAF1P04049 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAF1P04049 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms