Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
H3BQV1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
H3BQV1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
H3BQV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
H3BQV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
H3BQV1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
H3BQV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
H3BQV1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
H3BQV1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
H3BQV1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
H3BQV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
H3BQV1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
H3BQV1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
H3BQV1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
H3BQV1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
H3BQV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
H3BQV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
H3BQV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
H3BQV1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
H3BQV1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
H3BQV1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
H3BQV1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
H3BQV1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
H3BQV1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
H3BQV1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
H3BQV1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
H3BQV1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
H3BQV1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
H3BQV1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
H3BQV1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
H3BQV1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
H3BQV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
H3BQV1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
H3BQV1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
H3BQV1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
H3BQV1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
H3BQV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
H3BQV1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
H3BQV1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
H3BQV1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
H3BQV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
H3BQV1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
H3BQV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
H3BQV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
H3BQV1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
H3BQV1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
H3BQV1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
H3BQV1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
H3BQV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
H3BQV1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
H3BQV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
H3BQV1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
H3BQV1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
H3BQV1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
H3BQV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
H3BQV1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
H3BQV1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
H3BQV1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
H3BQV1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
H3BQV1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
H3BQV1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
H3BQV1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
H3BQV1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
H3BQV1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
H3BQV1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
H3BQV1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
H3BQV1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
H3BQV1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
H3BQV1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
H3BQV1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
H3BQV1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
H3BQV1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
H3BQV1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
H3BQV1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
H3BQV1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
H3BQV1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
H3BQV1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
H3BQV1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
H3BQV1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
H3BQV1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
H3BQV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
H3BQV1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
H3BQV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
H3BQV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
H3BQV1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
H3BQV1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
H3BQV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
H3BQV1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
H3BQV1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
H3BQV1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
H3BQV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
H3BQV1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
H3BQV1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
H3BQV1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
H3BQV1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
H3BQV1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
H3BQV1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
H3BQV1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
H3BQV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
H3BQV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms