Protein–RNA interactions for Protein: F8VVB4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VVB4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8VVB4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8VVB4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
F8VVB4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F8VVB4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F8VVB4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F8VVB4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F8VVB4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F8VVB4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F8VVB4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F8VVB4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8VVB4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8VVB4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8VVB4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F8VVB4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F8VVB4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F8VVB4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
F8VVB4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F8VVB4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F8VVB4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
F8VVB4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F8VVB4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
F8VVB4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8VVB4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8VVB4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8VVB4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F8VVB4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8VVB4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8VVB4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8VVB4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8VVB4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8VVB4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F8VVB4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
F8VVB4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F8VVB4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F8VVB4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
F8VVB4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
F8VVB4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
F8VVB4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
F8VVB4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
F8VVB4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
F8VVB4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
F8VVB4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
F8VVB4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
F8VVB4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
F8VVB4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
F8VVB4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F8VVB4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F8VVB4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
F8VVB4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F8VVB4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F8VVB4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
F8VVB4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8VVB4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8VVB4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8VVB4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8VVB4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F8VVB4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F8VVB4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F8VVB4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F8VVB4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F8VVB4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F8VVB4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F8VVB4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F8VVB4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F8VVB4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F8VVB4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F8VVB4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F8VVB4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F8VVB4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
F8VVB4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F8VVB4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F8VVB4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F8VVB4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F8VVB4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
F8VVB4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F8VVB4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F8VVB4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F8VVB4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F8VVB4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
F8VVB4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F8VVB4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F8VVB4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F8VVB4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F8VVB4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F8VVB4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
F8VVB4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F8VVB4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F8VVB4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F8VVB4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F8VVB4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8VVB4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8VVB4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8VVB4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8VVB4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8VVB4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
F8VVB4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
F8VVB4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F8VVB4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F8VVB4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms