Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TVP23AA6NH52 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TVP23AA6NH52 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TVP23AA6NH52 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TVP23AA6NH52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TVP23AA6NH52 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TVP23AA6NH52 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TVP23AA6NH52 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TVP23AA6NH52 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TVP23AA6NH52 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TVP23AA6NH52 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TVP23AA6NH52 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TVP23AA6NH52 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TVP23AA6NH52 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TVP23AA6NH52 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TVP23AA6NH52 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TVP23AA6NH52 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TVP23AA6NH52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TVP23AA6NH52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TVP23AA6NH52 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TVP23AA6NH52 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms