Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIP1Q9Y3R0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIP1Q9Y3R0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIP1Q9Y3R0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIP1Q9Y3R0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIP1Q9Y3R0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIP1Q9Y3R0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIP1Q9Y3R0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIP1Q9Y3R0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIP1Q9Y3R0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIP1Q9Y3R0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIP1Q9Y3R0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIP1Q9Y3R0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIP1Q9Y3R0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIP1Q9Y3R0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIP1Q9Y3R0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIP1Q9Y3R0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIP1Q9Y3R0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIP1Q9Y3R0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIP1Q9Y3R0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms