Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIP1Q9Y3R0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIP1Q9Y3R0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIP1Q9Y3R0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIP1Q9Y3R0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIP1Q9Y3R0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIP1Q9Y3R0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIP1Q9Y3R0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIP1Q9Y3R0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIP1Q9Y3R0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIP1Q9Y3R0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIP1Q9Y3R0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIP1Q9Y3R0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIP1Q9Y3R0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIP1Q9Y3R0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIP1Q9Y3R0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIP1Q9Y3R0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIP1Q9Y3R0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIP1Q9Y3R0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIP1Q9Y3R0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIP1Q9Y3R0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIP1Q9Y3R0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIP1Q9Y3R0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIP1Q9Y3R0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIP1Q9Y3R0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIP1Q9Y3R0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIP1Q9Y3R0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIP1Q9Y3R0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIP1Q9Y3R0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIP1Q9Y3R0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIP1Q9Y3R0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIP1Q9Y3R0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIP1Q9Y3R0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIP1Q9Y3R0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIP1Q9Y3R0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIP1Q9Y3R0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIP1Q9Y3R0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIP1Q9Y3R0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIP1Q9Y3R0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIP1Q9Y3R0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIP1Q9Y3R0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIP1Q9Y3R0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIP1Q9Y3R0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIP1Q9Y3R0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIP1Q9Y3R0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIP1Q9Y3R0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIP1Q9Y3R0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIP1Q9Y3R0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIP1Q9Y3R0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIP1Q9Y3R0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIP1Q9Y3R0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIP1Q9Y3R0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIP1Q9Y3R0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIP1Q9Y3R0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIP1Q9Y3R0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIP1Q9Y3R0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIP1Q9Y3R0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIP1Q9Y3R0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIP1Q9Y3R0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIP1Q9Y3R0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIP1Q9Y3R0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIP1Q9Y3R0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIP1Q9Y3R0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIP1Q9Y3R0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIP1Q9Y3R0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIP1Q9Y3R0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIP1Q9Y3R0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIP1Q9Y3R0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIP1Q9Y3R0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIP1Q9Y3R0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIP1Q9Y3R0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIP1Q9Y3R0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIP1Q9Y3R0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIP1Q9Y3R0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIP1Q9Y3R0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIP1Q9Y3R0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIP1Q9Y3R0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIP1Q9Y3R0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIP1Q9Y3R0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIP1Q9Y3R0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIP1Q9Y3R0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIP1Q9Y3R0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIP1Q9Y3R0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIP1Q9Y3R0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIP1Q9Y3R0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIP1Q9Y3R0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIP1Q9Y3R0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIP1Q9Y3R0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIP1Q9Y3R0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIP1Q9Y3R0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIP1Q9Y3R0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIP1Q9Y3R0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIP1Q9Y3R0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIP1Q9Y3R0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIP1Q9Y3R0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIP1Q9Y3R0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIP1Q9Y3R0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIP1Q9Y3R0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIP1Q9Y3R0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms