Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL26

RAB22A, Ras-related protein Rab-22A, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB22AQ9UL26 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB22AQ9UL26 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB22AQ9UL26 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB22AQ9UL26 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB22AQ9UL26 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB22AQ9UL26 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB22AQ9UL26 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB22AQ9UL26 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB22AQ9UL26 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB22AQ9UL26 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB22AQ9UL26 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB22AQ9UL26 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB22AQ9UL26 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB22AQ9UL26 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB22AQ9UL26 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB22AQ9UL26 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB22AQ9UL26 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms