Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNQ9P2M7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CGNQ9P2M7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CGNQ9P2M7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CGNQ9P2M7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNQ9P2M7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNQ9P2M7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNQ9P2M7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CGNQ9P2M7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CGNQ9P2M7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CGNQ9P2M7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNQ9P2M7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNQ9P2M7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CGNQ9P2M7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CGNQ9P2M7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CGNQ9P2M7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CGNQ9P2M7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CGNQ9P2M7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CGNQ9P2M7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNQ9P2M7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNQ9P2M7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNQ9P2M7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CGNQ9P2M7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CGNQ9P2M7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CGNQ9P2M7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNQ9P2M7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNQ9P2M7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNQ9P2M7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CGNQ9P2M7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CGNQ9P2M7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CGNQ9P2M7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CGNQ9P2M7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CGNQ9P2M7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNQ9P2M7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNQ9P2M7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CGNQ9P2M7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CGNQ9P2M7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNQ9P2M7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CGNQ9P2M7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CGNQ9P2M7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CGNQ9P2M7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CGNQ9P2M7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CGNQ9P2M7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNQ9P2M7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CGNQ9P2M7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CGNQ9P2M7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CGNQ9P2M7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNQ9P2M7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNQ9P2M7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CGNQ9P2M7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CGNQ9P2M7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CGNQ9P2M7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CGNQ9P2M7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CGNQ9P2M7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CGNQ9P2M7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNQ9P2M7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms