Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDP2Q9P2J9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDP2Q9P2J9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDP2Q9P2J9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDP2Q9P2J9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDP2Q9P2J9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDP2Q9P2J9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDP2Q9P2J9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDP2Q9P2J9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDP2Q9P2J9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDP2Q9P2J9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDP2Q9P2J9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDP2Q9P2J9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDP2Q9P2J9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDP2Q9P2J9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDP2Q9P2J9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDP2Q9P2J9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDP2Q9P2J9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDP2Q9P2J9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDP2Q9P2J9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDP2Q9P2J9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDP2Q9P2J9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDP2Q9P2J9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDP2Q9P2J9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDP2Q9P2J9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDP2Q9P2J9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDP2Q9P2J9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDP2Q9P2J9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDP2Q9P2J9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDP2Q9P2J9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDP2Q9P2J9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDP2Q9P2J9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDP2Q9P2J9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDP2Q9P2J9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDP2Q9P2J9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDP2Q9P2J9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDP2Q9P2J9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDP2Q9P2J9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDP2Q9P2J9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDP2Q9P2J9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDP2Q9P2J9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDP2Q9P2J9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDP2Q9P2J9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDP2Q9P2J9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms