Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSENENQ9NZ42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSENENQ9NZ42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSENENQ9NZ42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSENENQ9NZ42 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSENENQ9NZ42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSENENQ9NZ42 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSENENQ9NZ42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSENENQ9NZ42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms