Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PCMTD2Q9NV79 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCMTD2Q9NV79 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCMTD2Q9NV79 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCMTD2Q9NV79 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCMTD2Q9NV79 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCMTD2Q9NV79 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCMTD2Q9NV79 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCMTD2Q9NV79 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCMTD2Q9NV79 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCMTD2Q9NV79 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCMTD2Q9NV79 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCMTD2Q9NV79 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCMTD2Q9NV79 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCMTD2Q9NV79 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCMTD2Q9NV79 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCMTD2Q9NV79 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCMTD2Q9NV79 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCMTD2Q9NV79 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PCMTD2Q9NV79 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCMTD2Q9NV79 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCMTD2Q9NV79 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCMTD2Q9NV79 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCMTD2Q9NV79 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCMTD2Q9NV79 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCMTD2Q9NV79 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD2Q9NV79 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms