Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DLL4Q9NR61 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DLL4Q9NR61 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DLL4Q9NR61 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DLL4Q9NR61 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DLL4Q9NR61 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DLL4Q9NR61 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DLL4Q9NR61 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL4Q9NR61 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DLL4Q9NR61 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms