Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR41Q9HAD4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR41Q9HAD4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR41Q9HAD4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR41Q9HAD4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR41Q9HAD4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR41Q9HAD4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR41Q9HAD4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR41Q9HAD4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR41Q9HAD4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
WDR41Q9HAD4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR41Q9HAD4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR41Q9HAD4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR41Q9HAD4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR41Q9HAD4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR41Q9HAD4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR41Q9HAD4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR41Q9HAD4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR41Q9HAD4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR41Q9HAD4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR41Q9HAD4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR41Q9HAD4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR41Q9HAD4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR41Q9HAD4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR41Q9HAD4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR41Q9HAD4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR41Q9HAD4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR41Q9HAD4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR41Q9HAD4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR41Q9HAD4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR41Q9HAD4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR41Q9HAD4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR41Q9HAD4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR41Q9HAD4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR41Q9HAD4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR41Q9HAD4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR41Q9HAD4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
WDR41Q9HAD4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR41Q9HAD4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR41Q9HAD4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR41Q9HAD4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR41Q9HAD4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR41Q9HAD4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR41Q9HAD4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR41Q9HAD4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR41Q9HAD4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms