Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms