Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIF1Q9H611 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIF1Q9H611 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIF1Q9H611 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIF1Q9H611 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIF1Q9H611 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIF1Q9H611 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIF1Q9H611 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIF1Q9H611 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIF1Q9H611 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIF1Q9H611 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIF1Q9H611 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIF1Q9H611 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIF1Q9H611 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIF1Q9H611 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms