Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHAMP1Q96JM3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHAMP1Q96JM3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHAMP1Q96JM3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHAMP1Q96JM3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHAMP1Q96JM3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHAMP1Q96JM3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHAMP1Q96JM3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHAMP1Q96JM3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHAMP1Q96JM3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHAMP1Q96JM3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CHAMP1Q96JM3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHAMP1Q96JM3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHAMP1Q96JM3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHAMP1Q96JM3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHAMP1Q96JM3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHAMP1Q96JM3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHAMP1Q96JM3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHAMP1Q96JM3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CHAMP1Q96JM3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHAMP1Q96JM3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHAMP1Q96JM3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHAMP1Q96JM3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CHAMP1Q96JM3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHAMP1Q96JM3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHAMP1Q96JM3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHAMP1Q96JM3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHAMP1Q96JM3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHAMP1Q96JM3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAMP1Q96JM3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAMP1Q96JM3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAMP1Q96JM3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHAMP1Q96JM3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHAMP1Q96JM3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHAMP1Q96JM3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHAMP1Q96JM3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHAMP1Q96JM3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHAMP1Q96JM3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHAMP1Q96JM3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHAMP1Q96JM3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHAMP1Q96JM3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHAMP1Q96JM3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHAMP1Q96JM3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHAMP1Q96JM3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAMP1Q96JM3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAMP1Q96JM3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAMP1Q96JM3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHAMP1Q96JM3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHAMP1Q96JM3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHAMP1Q96JM3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms