Protein–RNA interactions for Protein: Q969X1

TMBIM1, Protein lifeguard 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM1Q969X1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMBIM1Q969X1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMBIM1Q969X1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMBIM1Q969X1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMBIM1Q969X1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMBIM1Q969X1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMBIM1Q969X1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMBIM1Q969X1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMBIM1Q969X1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMBIM1Q969X1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMBIM1Q969X1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMBIM1Q969X1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMBIM1Q969X1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMBIM1Q969X1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMBIM1Q969X1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMBIM1Q969X1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMBIM1Q969X1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMBIM1Q969X1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMBIM1Q969X1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMBIM1Q969X1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMBIM1Q969X1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMBIM1Q969X1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMBIM1Q969X1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMBIM1Q969X1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMBIM1Q969X1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMBIM1Q969X1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMBIM1Q969X1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMBIM1Q969X1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMBIM1Q969X1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMBIM1Q969X1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms