Protein–RNA interactions for Protein: Q92979

EMG1, Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMG1Q92979 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMG1Q92979 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMG1Q92979 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMG1Q92979 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMG1Q92979 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMG1Q92979 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMG1Q92979 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMG1Q92979 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMG1Q92979 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMG1Q92979 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMG1Q92979 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EMG1Q92979 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMG1Q92979 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMG1Q92979 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMG1Q92979 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms