Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB1CQ92928 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB1CQ92928 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB1CQ92928 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB1CQ92928 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB1CQ92928 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB1CQ92928 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB1CQ92928 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB1CQ92928 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB1CQ92928 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB1CQ92928 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB1CQ92928 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB1CQ92928 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB1CQ92928 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms