Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF397Q8NF99 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF397Q8NF99 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF397Q8NF99 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF397Q8NF99 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF397Q8NF99 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF397Q8NF99 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF397Q8NF99 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF397Q8NF99 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF397Q8NF99 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF397Q8NF99 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNF397Q8NF99 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF397Q8NF99 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF397Q8NF99 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF397Q8NF99 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF397Q8NF99 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF397Q8NF99 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF397Q8NF99 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF397Q8NF99 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF397Q8NF99 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF397Q8NF99 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF397Q8NF99 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF397Q8NF99 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF397Q8NF99 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF397Q8NF99 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF397Q8NF99 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF397Q8NF99 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF397Q8NF99 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF397Q8NF99 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF397Q8NF99 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF397Q8NF99 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF397Q8NF99 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF397Q8NF99 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF397Q8NF99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF397Q8NF99 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF397Q8NF99 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF397Q8NF99 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF397Q8NF99 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF397Q8NF99 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF397Q8NF99 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF397Q8NF99 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF397Q8NF99 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF397Q8NF99 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF397Q8NF99 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF397Q8NF99 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF397Q8NF99 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF397Q8NF99 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF397Q8NF99 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF397Q8NF99 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF397Q8NF99 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF397Q8NF99 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF397Q8NF99 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF397Q8NF99 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF397Q8NF99 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF397Q8NF99 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF397Q8NF99 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF397Q8NF99 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF397Q8NF99 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF397Q8NF99 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF397Q8NF99 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF397Q8NF99 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms