Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM29Q86T20 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM29Q86T20 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMIM29Q86T20 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM29Q86T20 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM29Q86T20 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms