Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CCDC141Q6ZP82 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC141Q6ZP82 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC141Q6ZP82 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC141Q6ZP82 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC141Q6ZP82 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC141Q6ZP82 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC141Q6ZP82 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC141Q6ZP82 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC141Q6ZP82 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC141Q6ZP82 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC141Q6ZP82 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC141Q6ZP82 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC141Q6ZP82 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CCDC141Q6ZP82 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CCDC141Q6ZP82 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CCDC141Q6ZP82 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CCDC141Q6ZP82 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC141Q6ZP82 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC141Q6ZP82 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC141Q6ZP82 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC141Q6ZP82 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC141Q6ZP82 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC141Q6ZP82 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CCDC141Q6ZP82 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CCDC141Q6ZP82 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC141Q6ZP82 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC141Q6ZP82 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC141Q6ZP82 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC141Q6ZP82 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC141Q6ZP82 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC141Q6ZP82 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
CCDC141Q6ZP82 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC141Q6ZP82 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CCDC141Q6ZP82 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
CCDC141Q6ZP82 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
CCDC141Q6ZP82 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC141Q6ZP82 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC141Q6ZP82 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC141Q6ZP82 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC141Q6ZP82 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CCDC141Q6ZP82 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC141Q6ZP82 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CCDC141Q6ZP82 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CCDC141Q6ZP82 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC141Q6ZP82 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC141Q6ZP82 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC141Q6ZP82 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CCDC141Q6ZP82 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CCDC141Q6ZP82 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC141Q6ZP82 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC141Q6ZP82 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC141Q6ZP82 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC141Q6ZP82 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC141Q6ZP82 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC141Q6ZP82 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC141Q6ZP82 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC141Q6ZP82 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC141Q6ZP82 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC141Q6ZP82 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CCDC141Q6ZP82 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CCDC141Q6ZP82 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC141Q6ZP82 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC141Q6ZP82 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC141Q6ZP82 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms