Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.64■■■■■ 6.02
CCDC141Q6ZP82 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.97■■■■■ 5.91
CCDC141Q6ZP82 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
CCDC141Q6ZP82 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.16■■■■■ 5.78
CCDC141Q6ZP82 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
CCDC141Q6ZP82 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.7■■■■■ 5.71
CCDC141Q6ZP82 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
CCDC141Q6ZP82 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.37■■■■■ 5.65
CCDC141Q6ZP82 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.7■■■■■ 5.55
CCDC141Q6ZP82 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.54■■■■■ 5.52
CCDC141Q6ZP82 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.51■■■■■ 5.52
CCDC141Q6ZP82 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC49.48■■■■■ 5.51
CCDC141Q6ZP82 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
CCDC141Q6ZP82 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.16■■■■■ 5.46
CCDC141Q6ZP82 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
CCDC141Q6ZP82 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
CCDC141Q6ZP82 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
CCDC141Q6ZP82 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
CCDC141Q6ZP82 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
CCDC141Q6ZP82 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
CCDC141Q6ZP82 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.37■■■■■ 5.33
CCDC141Q6ZP82 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.3■■■■■ 5.32
CCDC141Q6ZP82 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
CCDC141Q6ZP82 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
CCDC141Q6ZP82 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
CCDC141Q6ZP82 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.08■■■■■ 5.29
CCDC141Q6ZP82 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
CCDC141Q6ZP82 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
CCDC141Q6ZP82 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
CCDC141Q6ZP82 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.68■■■■■ 5.22
CCDC141Q6ZP82 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
CCDC141Q6ZP82 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.55■■■■■ 5.2
CCDC141Q6ZP82 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
CCDC141Q6ZP82 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.26■■■■■ 5.16
CCDC141Q6ZP82 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC141Q6ZP82 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.13■■■■■ 5.13
CCDC141Q6ZP82 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
CCDC141Q6ZP82 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
CCDC141Q6ZP82 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
CCDC141Q6ZP82 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
CCDC141Q6ZP82 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
CCDC141Q6ZP82 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC46.63■■■■■ 5.06
CCDC141Q6ZP82 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
CCDC141Q6ZP82 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
CCDC141Q6ZP82 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
CCDC141Q6ZP82 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
CCDC141Q6ZP82 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
CCDC141Q6ZP82 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CCDC141Q6ZP82 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
CCDC141Q6ZP82 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CCDC141Q6ZP82 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
CCDC141Q6ZP82 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC141Q6ZP82 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CCDC141Q6ZP82 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
CCDC141Q6ZP82 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
CCDC141Q6ZP82 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
CCDC141Q6ZP82 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
CCDC141Q6ZP82 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
CCDC141Q6ZP82 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
CCDC141Q6ZP82 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CCDC141Q6ZP82 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
CCDC141Q6ZP82 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CCDC141Q6ZP82 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
CCDC141Q6ZP82 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CCDC141Q6ZP82 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
CCDC141Q6ZP82 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CCDC141Q6ZP82 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CCDC141Q6ZP82 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
CCDC141Q6ZP82 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC141Q6ZP82 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CCDC141Q6ZP82 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
CCDC141Q6ZP82 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
CCDC141Q6ZP82 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CCDC141Q6ZP82 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CCDC141Q6ZP82 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC141Q6ZP82 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC141Q6ZP82 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CCDC141Q6ZP82 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CCDC141Q6ZP82 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CCDC141Q6ZP82 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CCDC141Q6ZP82 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CCDC141Q6ZP82 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC141Q6ZP82 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CCDC141Q6ZP82 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC141Q6ZP82 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC141Q6ZP82 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC141Q6ZP82 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
CCDC141Q6ZP82 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
CCDC141Q6ZP82 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
CCDC141Q6ZP82 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
CCDC141Q6ZP82 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
CCDC141Q6ZP82 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CCDC141Q6ZP82 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CCDC141Q6ZP82 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
CCDC141Q6ZP82 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC141Q6ZP82 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
CCDC141Q6ZP82 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
CCDC141Q6ZP82 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
CCDC141Q6ZP82 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
CCDC141Q6ZP82 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.2 ms