Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18B1Q6NT16 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18B1Q6NT16 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18B1Q6NT16 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18B1Q6NT16 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18B1Q6NT16 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18B1Q6NT16 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18B1Q6NT16 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18B1Q6NT16 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18B1Q6NT16 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18B1Q6NT16 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC18B1Q6NT16 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18B1Q6NT16 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18B1Q6NT16 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18B1Q6NT16 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC18B1Q6NT16 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms