Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAPCD1Q5SSQ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAPCD1Q5SSQ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAPCD1Q5SSQ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms