Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTU2Q2VPK5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTU2Q2VPK5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU2Q2VPK5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU2Q2VPK5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU2Q2VPK5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU2Q2VPK5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTU2Q2VPK5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTU2Q2VPK5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU2Q2VPK5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU2Q2VPK5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms