Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP5B1Q2VPB7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP5B1Q2VPB7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP5B1Q2VPB7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP5B1Q2VPB7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP5B1Q2VPB7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP5B1Q2VPB7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP5B1Q2VPB7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP5B1Q2VPB7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP5B1Q2VPB7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP5B1Q2VPB7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP5B1Q2VPB7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP5B1Q2VPB7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP5B1Q2VPB7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP5B1Q2VPB7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP5B1Q2VPB7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP5B1Q2VPB7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP5B1Q2VPB7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP5B1Q2VPB7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP5B1Q2VPB7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP5B1Q2VPB7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP5B1Q2VPB7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP5B1Q2VPB7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP5B1Q2VPB7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP5B1Q2VPB7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP5B1Q2VPB7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP5B1Q2VPB7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP5B1Q2VPB7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AP5B1Q2VPB7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP5B1Q2VPB7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
AP5B1Q2VPB7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AP5B1Q2VPB7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP5B1Q2VPB7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms