Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR6A1Q15406 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR6A1Q15406 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR6A1Q15406 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR6A1Q15406 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NR6A1Q15406 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NR6A1Q15406 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR6A1Q15406 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR6A1Q15406 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR6A1Q15406 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR6A1Q15406 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NR6A1Q15406 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NR6A1Q15406 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
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