Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL3Q13618 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL3Q13618 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL3Q13618 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL3Q13618 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL3Q13618 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL3Q13618 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL3Q13618 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL3Q13618 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL3Q13618 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL3Q13618 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL3Q13618 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL3Q13618 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CUL3Q13618 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL3Q13618 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CUL3Q13618 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL3Q13618 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL3Q13618 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
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