Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNB3Q05901 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNB3Q05901 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNB3Q05901 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNB3Q05901 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNB3Q05901 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNB3Q05901 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNB3Q05901 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNB3Q05901 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNB3Q05901 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CHRNB3Q05901 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNB3Q05901 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNB3Q05901 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNB3Q05901 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNB3Q05901 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNB3Q05901 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNB3Q05901 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNB3Q05901 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNB3Q05901 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNB3Q05901 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNB3Q05901 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNB3Q05901 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNB3Q05901 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB3Q05901 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB3Q05901 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB3Q05901 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNB3Q05901 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNB3Q05901 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNB3Q05901 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNB3Q05901 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNB3Q05901 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNB3Q05901 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms