Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBXN1Q04323 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBXN1Q04323 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBXN1Q04323 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
UBXN1Q04323 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBXN1Q04323 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBXN1Q04323 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBXN1Q04323 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBXN1Q04323 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBXN1Q04323 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBXN1Q04323 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBXN1Q04323 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN1Q04323 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UBXN1Q04323 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBXN1Q04323 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms