Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX6A2Q02221 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX6A2Q02221 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A2Q02221 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A2Q02221 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX6A2Q02221 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX6A2Q02221 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A2Q02221 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms