Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTG2P63267 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTG2P63267 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTG2P63267 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTG2P63267 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTG2P63267 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTG2P63267 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTG2P63267 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTG2P63267 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTG2P63267 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTG2P63267 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTG2P63267 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTG2P63267 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTG2P63267 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTG2P63267 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTG2P63267 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTG2P63267 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTG2P63267 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTG2P63267 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms