Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERV-K104P61576 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERV-K104P61576 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERV-K104P61576 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERV-K104P61576 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERV-K104P61576 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HERV-K104P61576 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERV-K104P61576 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERV-K104P61576 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERV-K104P61576 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERV-K104P61576 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERV-K104P61576 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HERV-K104P61576 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERV-K104P61576 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HERV-K104P61576 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERV-K104P61576 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms