Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPCS3P61009 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPCS3P61009 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPCS3P61009 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPCS3P61009 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPCS3P61009 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPCS3P61009 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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