Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH11P55287 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH11P55287 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH11P55287 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH11P55287 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH11P55287 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH11P55287 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH11P55287 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH11P55287 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH11P55287 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH11P55287 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH11P55287 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH11P55287 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH11P55287 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH11P55287 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH11P55287 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH11P55287 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH11P55287 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH11P55287 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH11P55287 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH11P55287 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH11P55287 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH11P55287 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH11P55287 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH11P55287 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH11P55287 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH11P55287 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH11P55287 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH11P55287 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH11P55287 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH11P55287 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH11P55287 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH11P55287 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH11P55287 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH11P55287 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH11P55287 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH11P55287 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH11P55287 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH11P55287 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH11P55287 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH11P55287 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH11P55287 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH11P55287 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH11P55287 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH11P55287 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH11P55287 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH11P55287 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH11P55287 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH11P55287 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH11P55287 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH11P55287 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH11P55287 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH11P55287 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH11P55287 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH11P55287 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH11P55287 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH11P55287 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH11P55287 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH11P55287 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH11P55287 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH11P55287 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH11P55287 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH11P55287 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH11P55287 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH11P55287 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH11P55287 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH11P55287 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH11P55287 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH11P55287 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH11P55287 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH11P55287 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH11P55287 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH11P55287 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH11P55287 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH11P55287 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH11P55287 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH11P55287 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH11P55287 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH11P55287 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH11P55287 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH11P55287 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH11P55287 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH11P55287 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH11P55287 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH11P55287 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH11P55287 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH11P55287 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH11P55287 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH11P55287 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH11P55287 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH11P55287 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH11P55287 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH11P55287 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH11P55287 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH11P55287 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH11P55287 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH11P55287 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH11P55287 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH11P55287 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH11P55287 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms