Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDH11P55287 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDH11P55287 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDH11P55287 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDH11P55287 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDH11P55287 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDH11P55287 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDH11P55287 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDH11P55287 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDH11P55287 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDH11P55287 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDH11P55287 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDH11P55287 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDH11P55287 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDH11P55287 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH11P55287 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH11P55287 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH11P55287 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDH11P55287 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDH11P55287 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDH11P55287 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDH11P55287 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH11P55287 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDH11P55287 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH11P55287 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH11P55287 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH11P55287 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH11P55287 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH11P55287 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH11P55287 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH11P55287 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH11P55287 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH11P55287 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH11P55287 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH11P55287 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDH11P55287 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH11P55287 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH11P55287 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDH11P55287 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH11P55287 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH11P55287 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH11P55287 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH11P55287 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH11P55287 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDH11P55287 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH11P55287 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH11P55287 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH11P55287 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH11P55287 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH11P55287 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH11P55287 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH11P55287 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH11P55287 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH11P55287 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH11P55287 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH11P55287 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH11P55287 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH11P55287 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH11P55287 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH11P55287 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH11P55287 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH11P55287 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH11P55287 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH11P55287 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH11P55287 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH11P55287 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH11P55287 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH11P55287 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH11P55287 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH11P55287 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH11P55287 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH11P55287 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH11P55287 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH11P55287 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH11P55287 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH11P55287 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH11P55287 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH11P55287 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH11P55287 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH11P55287 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH11P55287 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH11P55287 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH11P55287 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH11P55287 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH11P55287 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH11P55287 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH11P55287 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH11P55287 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH11P55287 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH11P55287 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH11P55287 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH11P55287 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH11P55287 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH11P55287 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH11P55287 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH11P55287 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDH11P55287 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH11P55287 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH11P55287 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH11P55287 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms